D'un point de vue architectural, la mosquée possède une salle de prière rectangulaire plus profonde que large et qui comporte sept nefs de neuf travées. Les arcs brisés outrepassés, délimitant des voûtes d'arêtes, reposent par l'intermédiaire d'impostes sur des colonnes en marbre surmontées de chapiteaux hafsides.Le mihrab, dont la niche est revêtue de panneaux de marbre, est coiffé d'une coupole à stalactites réalisées en plâtre finement sculpté et flanqué de colonnettes à chapiteaux dorés. À proximité, se trouve le minbar de style ottoman, en maçonnerie plaquée de marbre, qui remplace le minbar original en bois d'époque hafside3. On trouve à ses côtés une inscription en langue turque rappelant les travaux réalisés en 1584.